شناخت مسئله از اولین و مهمترین مراحل سیاستگذاری است. در حوزه آب و محیطزیست، یکی از مسائلی که کشور ایران با آن در طول سالهای مختلف روبهرو بوده است، مسئله آبهای فرامرزی مشترک میان ایران و افغانستان در شرق کشور است. این مسئله بیش از یکصد سال دامنگیر سیاستمداران ایران بوده است. این مقاله متمرکز بر شناخت درهمتنیدگی شبکه مسائل آبی میان ایران و افغانستان در منطقه سیستان است. بهمنظور شناسایی عناصر متعدد اثرگذار بر شرایط وخیم و بدخیم سیستان، در این مقاله با روش توصیفی-تشریحی و با استناد به مراجع کتابخانهای «ماتریس مسائل آب سیستان» معرفی میشود. نتایج پژوهش نشان داد که مسائل آب سیستان دارای سطوح محلی-استانی، ملی و بینالمللی است که در سه حوزه محیطزیست و اقلیم، کشاورزی و شرب بهصورت درهمتنیده با یکدیگر در تعامل هستند. در خصوص سطح بینالمللی مسائل آب سیستان، در این مقاله به شرایط داخلی افغانستان و مأموریت هیدرولیکی در این کشور در کنار برساخت هویت اجتماعی غیرشده با هدف دولت-ملتسازی اشاره شده است. از دیگر عوامل بینالمللی اثرگذار بر شرایط ایجاد شده حال حاضر در سیستان، نقش کشورهای ثالث برای پیشبرد منافع خودشان است.